我校计算生物中心科研又获新进展

　　绿色新闻网报道  近日，国际著名生物信息学期刊《 Briefings in Bioinformatics 》（2015年影响因子9.617）在线发表了我校计算生物学中心硕士研究生颜芹、祝绪礼、姜立波的论文《A computing platform to map ecological metabolism by integrating functional mapping and the metabolic theory of ecology》。

　　在论文中，颜芹等人把复杂性状基因定位的“功能作图”理论与生态学中最近几年发展起来的“生态代谢理论”相结合，推导出能估算、预测生物群落中生物能量积累、传递的生理机理，并从DNA层面上挖掘产生这种机理的生物原动力。

　　“功能作图”是计算生物学家邬荣领博士发明的一种统计方法，用于性状发育模式与进程的基因定位，在包括农作物产物、林木生长与人类疾病在内的数量性状遗传调控机理研究领域，已有许多重要应用。“生态代谢理论”是国际著名生态学家、美国科学院院士James Brown博士首次提出的生态系统生态学研究思想，它是Kleiber规律的扩展，认为生物的代谢速率是控制生物系统中各物种生态互作的最基本要素。按照这一理论，人们可以对小至细胞大至生物圈的生物学特性进行系统的机理性研究。

　　颜芹等把这两种理论巧妙交叉并藕合在一起，把“代谢生态理论”上升到DNA水平，又将“功能作图”推进到生态系统的遗传机理研究领域，丰富了数量遗传学与生态系统生态学的研究内涵。

　　除了理论推断之后，颜芹等广泛阅读文献，从《 Journal of Evolutionary Biology 》发现一篇工作能支持他们的想法。通过与论文作者，南非Stellenbosch University生态学教授John Terblanche博士联系，获取他的数据并用这套数据验证了他们的的理论模型，最终共同发表了这篇论文。这篇跨学科的研究论文凸显了我校计算生物学中心研究生开创的想法与敏锐的洞察力。（A15）